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病毒重组是自然发生的事件，也是PRRSV遗传进化的推动力量。自1990年代晚期，实验室细胞培养试验中就有病毒重组的报道。要发生病毒重组，两种病毒必须感染同一个细胞并进行复制，通过交换遗传物质衍生出新一代病毒（图1）。
图1: 产生新病毒的重组事件的示意图。两条线交叉点前后的区域表示从两种亲本病毒中获得的基因组。基因组区域显示在顶部。
近期的文献中，病毒重组被报道发生在：
- 野生型病毒
- 减毒活疫苗病毒（MLV）
- 野生毒株何疫苗病毒之间
病毒重组事件可能一直在田间发生，只是近年来NGS（见pig333.com网站发表于2025年6月2日的文章“蓝耳病（PRRS）的分子诊断中，当测序覆盖率仅达4%时是不够的。”）测序以及用于重组分析的生物信息学可用工具的使用越来越多，这提高了我们检测重组事件的能力。
发生在田间的许多重组事件可能产生失活的病毒或无法确立稳定感染且持续存在的病毒。两种不同的野生病毒毒株的重组会引起更大的动物健康关切（图2）。
最近出现的Rosalia和L1C.5毒株是高致病性的野生型重组PRRS病毒的例子，这些病毒在猪群中已经流行，并引起了严重的临床症状。
然而，仍然存在以下问题：
- 为何仍能看到更多基于MLV疫苗病毒的重组PRRSV？
- 这些新的病毒发生了什么？
MLV疫苗的标签推荐用于健康动物，以便在野生型病毒感染前建立个体免疫力。在野生型PRRSV的防控中，MLV病毒常与野生型病毒共同流行。MLV衍生出的重组病毒通常不如野生型病毒或野生重组病毒株的致病性那么强 （图 2）。
在美国，案例报道证实了采取防控措施（如加强生物隔离和生物安全实践）来阻断病毒在不同产房之间的传播，并提升个体仔猪的免疫力，能有效降低新出现的 PRRSV-2 MLV衍生病毒引起的临床症状。在欧洲，关于PRRSV-1 MLV衍生的重组病毒的临床试验报道显示，其致病性既不如MLV病毒温和，也不及野生型病毒强烈。
实验室中基于野生型病毒和MLV疫苗病毒构建了PRRSV-2重组嵌合病毒并在试验条件下给猪接种，结果显示其产生的临床症状较野生型病毒温和，但尚未证实其临床反应如亲代MLV疫苗病毒那样温和（图2）。此外，也有报道，田间分离到的MLV疫苗和田间毒株重组病毒呈现难以在细胞中培养的更多问题。
图 2: 检测不同PRRSV之间重组事件的生物信息学能力和临床意义。
| PRRS 毒株 | 临床意义 | 检测重组病毒的生物信息学能力 |
|---|---|---|
| 改造的活病毒（MLV） |  |
 |
| MLV 和MLV重组病毒 | ||
| MLV 和wt-PRRSV重组病毒 | ||
| 野生型 PRRSV (wt-PRRSV) | ||
| wt-PRRS和wt-PRRSV重组病毒 |
一些国家用于管理PRRSV的另一种方法是实施活病毒接种（LVI），这包括直接从现场收集样本（如血清或肺），通过RT-PCR方法确认PRRSV的存在，然后在培养基中稀释样本，并将动物暴露于农场存在的病毒中。
田间病毒不会像MLV那样被减毒，值得注意的是，LVI可能在不知不觉中包含PRRSV的多种毒株，为野生型病毒重组创造了机会
此外，LVI材料的使用在许多国家都没有获得法律许可，并且可能含有供体血液中循环的其他病原体，如猪圆环病毒、猪细小病毒等，这给疾病控制带来了额外的挑战。
拥有多个PRRS毒株和/或重组病毒的影响是什么？
- 与感染≤2株毒株的猪群相比，感染≥3株PRRSV毒株的繁殖猪群每1000头母猪多损失1837头仔猪，这说明，即群体/猪群/猪中传播的PRRSV毒株越多，临床影响/症状就越大（越多=越差）；
- 在PRRSV清除过程中，检测到≥3株PRRSV的繁殖群比≤2株的繁殖群达到稳定所需要的时间多出12周；
- 与未检测到重组病毒的农场相比，在疫情爆发时鉴定出PRRSV重组病毒的猪场每1000头母猪多损失1827头仔猪。
控制PRRS有助于减少病毒重组的发生
一些案例如下：
- 避免引入感染了不同于繁殖群中存在的PRRSV毒株的后备母猪；
- 避免将感染不同野生型PRRSV毒株的保育猪和育肥猪混养；
- 注射前使用NGS检测LVI样品并避免使用含有多种不同基因型PRRSV的LVI材料；
- 如果LVI材料中含有MLV样的病毒，使用生产疫苗的MLV病毒而不要用田间病毒；
- 使用MLV时，避免混合或同时注射两种MLV病毒。也要避免在猪场或生产体系中轮换使用MLV疫苗；
- 根据MLV标签推荐说明在健康动物中正确使用，以在预期感染野生型毒株前建立个体免疫。
PRRSV已成为一种具有挑战性的动物健康威胁因子，并且随着时间在基因上不断进化。控制PRRSV不仅可以提高生产成绩，还可以减少不同野生型病毒重组的机会以及产生更具致病性的病毒的机会。
