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使用全基因组测序对来自不同来源和地点（即美国和欧洲）的659 株沙门氏菌 4,[5],12:i:-和325株鼠伤寒沙门氏菌的多重比较以评估其遗传异质性，重点为从美国中西部地区的猪群中采集的菌株。此外，还检测了抗性基因和其它毒力因子的存在，并分别确定了50株家畜和22株人源分离株的抗微生物耐药性表型。
不论其来源和地理起源，沙门氏菌4，[5]，12：i：- 菌株形成了两个主要的进化枝。大部分（84％）2014-2016年间收集的美国分离株，包括从美国中西部地区猪中收集的（50/51）分离株，都是新兴分支的一部分。在该进化枝中，多重基因型耐药决定簇占主导地位，包括对氨苄青霉素，链霉素，磺胺和四环素（ASSuT）的耐药性。同时具有对恩氟沙星（11/50）和头孢噻呋（9/50）的表型耐药性，且存在质粒介导的抗性基因（分别为qnrB19 / qnrB2 / qnrS1和blaCMY-2 / blaSHV-12）。 此外，在沙门氏菌4，[5]，12：i：中发现来自欧洲的新出现的分支和鼠伤寒沙门氏菌的相似性比来自美国的鼠伤寒沙门氏菌更高。
目前在美国中西部地区的猪群中流行的沙门氏菌4，[5]，12：i：可能是欧洲首次报道的新兴多药耐药进化枝的一部分，且可携带质粒介导的抗性基因，并可能水平传播到其他细菌，因此可造成公众健康问题。
Ehud Elnekave, Samuel Hong, Alison E Mather, Dave Boxrud, Angela J Taylor, Victoria Lappi, Timothy J Johnson, Fabio Vannucci, Peter Davies, Craig Hedberg, Andres Perez, Julio Alvarez; Salmonella enterica serotype 4,[5],12:i:- in swine in the United States Midwest: an emerging multidrug resistant clone, Clinical Infectious Diseases, , cix909, https://doi.org/10.1093
